Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms