Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitpnm3Q3UHE1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms