Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trip13Q3UA06 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trip13Q3UA06 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trip13Q3UA06 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trip13Q3UA06 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trip13Q3UA06 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trip13Q3UA06 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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