Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U7U4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms