Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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