Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms