Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem35bQ3U0Y2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms