Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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