Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Shcbp1lQ3TTP0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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