Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms