Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TQQ9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms