Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms