Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms