Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne9Q1RLL3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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