Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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