Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms