Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Spatc1Q148B6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Spatc1Q148B6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Spatc1Q148B6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Spatc1Q148B6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Spatc1Q148B6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Spatc1Q148B6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Spatc1Q148B6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spatc1Q148B6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spatc1Q148B6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms