Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q08AU9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q08AU9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q08AU9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q08AU9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q08AU9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q08AU9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q08AU9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q08AU9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms