Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnma1Q08460 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms