Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb2Q08331 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms