Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NrepQ07475 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms