Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gdf3Q07104 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms