Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf4Q06507 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf4Q06507 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf4Q06507 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms