Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fmn1Q05860 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fmn1Q05860 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms