Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms