Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox12Q04890 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms