Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms