Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx2Q03358 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms