Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms