Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms