Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms