Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms