Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms