Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SeleQ00690 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms