Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms