Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa1Q00623 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms