Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx1P83917 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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