Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgcdP82347 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgcdP82347 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SgcdP82347 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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