Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms