Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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