Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms