Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba4aP68368 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tuba4aP68368 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tuba4aP68368 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms