Protein–RNA interactions for Protein: P63330

Ppp2ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2caP63330 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp2caP63330 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms