Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scarf2P59222 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms