Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms