Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms