Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms