Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms