Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CckbrP56481 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CckbrP56481 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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