Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms